Python Module Index

b | g | p | r | u
 
b
plastid.bin
    plastid.bin.counts_in_region
    plastid.bin.crossmap
    plastid.bin.cs
    plastid.bin.findjuncs
    plastid.bin.get_count_vectors
    plastid.bin.gff_parent_types
    plastid.bin.make_wiggle
    plastid.bin.metagene
    plastid.bin.phase_by_size
    plastid.bin.psite
    plastid.bin.reformat_transcripts
    plastid.bin.slidejuncs
    plastid.bin.test_table_equality
 
g
plastid.genomics
    plastid.genomics.c_common
    plastid.genomics.genome_array
    plastid.genomics.genome_hash
    plastid.genomics.map_factories
    plastid.genomics.roitools
    plastid.genomics.seqtools
    plastid.genomics.splicing
 
p
plastid
plastid.plotting
    plastid.plotting.colors
    plastid.plotting.plots
    plastid.plotting.plotutils
 
r
plastid.readers
    plastid.readers.autosql
    plastid.readers.bbifile
    plastid.readers.bed
    plastid.readers.bigbed
    plastid.readers.bigwig
    plastid.readers.bowtie
    plastid.readers.common
    plastid.readers.gff
    plastid.readers.gff_tokens
    plastid.readers.psl
    plastid.readers.wiggle
 
u
plastid.util
    plastid.util.io
    plastid.util.io.binary
    plastid.util.io.filters
    plastid.util.io.openers
    plastid.util.scriptlib
    plastid.util.scriptlib.argparsers
    plastid.util.scriptlib.help_formatters
    plastid.util.scriptlib.template
    plastid.util.services
    plastid.util.services.decorators
    plastid.util.services.exceptions
    plastid.util.services.lists
    plastid.util.services.mini2to3
    plastid.util.services.misc
    plastid.util.services.sets
    plastid.util.unique_fifo